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滿清政府時期，當時從中國大陸渡海來台開墾的漢人日漸增多，康熙年間，到士林開墾的居民主要以福建省漳州府移民為主，當時以「圓山仔」來稱呼芝山岩，後來又覺得這座林木蒼鬱的小山很像漳州故鄉的名勝「芝山」，才將它改名為「芝山岩」。「芝山獨峙」也是昔日士林的八景之一。
漳州人從大陸到台灣移墾，也把守護鄉土的神明「開漳聖王」一起帶來，並於乾隆年間在芝山岩創建惠濟宮，由於香火鼎盛，惠濟宮也漸漸成為士林地區漳州人的宗教信仰中心。
清朝嘉慶到同治年間，漳泉移民為了爭奪水利、商業利益時有所衝突，因而械鬥頻繁。清道光5年（西元1825年）漳州人在芝山岩建築隘門用來防禦當時泉州人的攻打；清朝咸豐9年（西元1859年）士林當地人把在械鬥中喪亡的漳州及泉州的百姓合葬於山頂上，即為現在的大墓公---「同歸所」。
芝山岩惠濟宮沿革:
士林芝山岩，位於臺北市士林區行政中心東北約2公里處，為一孤立小山丘，海拔在50公尺左右，面積約10甲許，東西長有400公尺，南北最寬處150公尺，狀如福建漳州芝山岩。
惠濟宮位於芝山岩山頂偏西處，廟中供奉漳州人的守護神開漳聖王陳元光，所以也稱為「士林開漳聖王廟」。開漳聖王又稱威惠聖王、陳將軍等，簡稱「聖王公」，本姓陳，名元光，河南光州人，669年時隨父領兵入閩， 687年首任漳州刺史。生前對於漳州的開拓與教化貢獻頗大，受到漳州人的崇敬。逝世後，敕封為威惠聖王，不僅為漳州人所奉，更為漳州籍陳姓族人的始祖。清康熙年間，漳州人移居臺北盆地北邊的唭哩岸一帶（今石牌）開墾，墾拓範圍及於士林和芝山岩一帶。為了感念開漳聖王護國庇民的恩澤，乃建惠濟宮於山巔西側。
芝山岩惠濟宮另外有一傳說，相傳清朝康熙年間當時祖籍漳州府平和縣人，有黃善族親黃澄清來臺，隨身攜帶開漳聖王香火包，將其供奉在黃家廳堂上，每日朝夕焚香膜拜，斯時附近田園農作物發生病蟲害，黃善之妻即向聖王香火包祈求驅除蟲害，果真是日起連續三天的夜晚，田園出發許多紅色火光，居民信其是神火，不久蟲害消除。在濫仔（蘭雅）、三再埔一帶地區也有類似事情發生，以是八芝蘭居民，更加信奉聖王神靈顯赫了。
芝山岩惠濟宮，廟始建於清乾隆十七年〈西元1752年〉，於清乾隆二十九年〈1764年〉竣工。其後經歷嘉慶十六年〈西元1811年〉、道光五年〈1825年〉、同治十年〈西元1871年〉、光緒十六年〈西元1890年〉、民國六年〈西元1917年〉等前後五次重建。今廟為民國五十七年〈西元1968年〉重建，多為鋼筋混凝土構造，只嵌入局部舊有石雕。
清道光20年(西元1840年)八芝蘭街士紳潘永清(號定民)於惠濟宮後方建文昌祠供奉文昌帝君。並於祠內設義塾，免費教育地方子弟，成立芝山巖講舍是為「文昌祠義學」，教授漢文，文人雅士常會於此。早期附近學子會到芝山岩來求學，使八芝蘭讀書風氣盛行，考中的秀才、舉人很多，培養出許多儒生學子，如：潘成清舉人、施贊隆舉人。後來有名的老師還有曹敬、曹天相、楊錫侯、魏炳文、邱仁、曹迪臣、何炳奎、朱煥全、賴維邦等都曾到義塾教書。光緒16年文昌帝君移到惠濟宮後殿二樓奉祀。現在惠濟宮後殿二樓祭祀文昌帝君，每逢考季都會有考生至此，拜蔥(聰明)、芹菜(勤勞)和蘿蔔(彩頭)並附上准考證、點燈，祈求金榜題名。
日治初期，日人設學務部於芝山岩惠濟宮內，同時首設臺灣第一所國語（日語）傳習所於惠濟宮後殿之文昌祠義塾，並以學堂為上課地點，藉以推展日語教育。1896年元旦，抗日義民在路上襲擊，盡殺日籍教師六名及工友一名，後來日軍向士林居民採取武力鎮壓行動，史稱「芝山岩事件」。同年，臺灣總督府重設並直轄芝山岩被毀的國（日）語傳習所，而且改稱為臺灣總督府國語學校。
1917年，惠濟宮因受白蟻侵蝕，廟體受損嚴重，以前殿為最，然而捐款不足，工程延後。1922年，惠濟宮住僧范真淨出面募款，使得修建及增建工程得以繼續，1923年才得以完工。芝山岩惠濟宮的建築，在經過數度重修以後，現有殿宇為第二次世界大戰後重建，主要以鋼筋混凝土建材營建，取代傳統「木構造」方式，並於門廳廟兩側處興建鐘樓與鼓樓，廟門前方增建天公爐一座，並在廟埕左側增建金亭一座。
目前芝山岩惠濟宮為七開間、兩殿、兩廊、兩護龍的廟宇建築。三開間的前殿用硬山燕尾翹脊屋頂，中門前立蟠龍檐柱一對，兩側有新建兩層的鐘樓與鼓樓各一座。
西隘門、蛇蛙石沿革:
芝山岩為士林平原上一聳立之小丘，山形峻峭且易守難攻。於是漳州人在四個山凹處設置了東、西、南、北四個隘門，以管制芝山岩的四個出入口。如今東、南兩隘門已不存在，北隘門則由台北市公園路燈管理處改建過，只有西隘門尚稱完整。
芝山巖隘門，建於清道光五年（西元1825年），為漳泉械鬥之遺蹟。此隘門係為昔日漳州人之防禦工事，純用當地所產石材建築，石城上設雉堞、有銃孔。原門有四，以東、西、南、北名之，今存者僅有西門，也稱西隘門。隘門內有惠濟宮、大墓公諸聖蹟，門外巨巖上刻有「洞天福地」四大字，為清代士林名士潘清所題，闡明芝山巖富有鐘靈毓秀之美。
西隘門為目前台北地區唯一保持原形的隘門，所以被內政部定為三級古蹟。蛇蛙石是芝山岩特殊的地質景觀，為一整塊崩落的岩石。蛇頭朝向西隘門，守護西隘門，主要由兩塊大石頭相疊而成。
西隘門的守護神為蛇蛙石，相傳石蛇是受開漳聖王的命令守護西隘門，現在遊客只要通過西隘門，即可到達惠濟宮。
芝山岩惠濟宮參觀資訊:
所在位置： 臺北市111士林區至誠路1段326巷26號
傳真號碼： 886-2-2831-6178
聯絡電話： 886-2-2831-5656
開放時間： 每日05:00~19:00
交通資訊：
1.公車：206、267(副)、645、645(副)至芝山公園站或惠濟宮站
2.停車資訊：至誠平面停車場 士林區至誠路1段295號對面
捷運站名：台北捷運士林站或芝山站步行約15分鐘
